盧加閔生於英國蘇格蘭Bathgate鎮，畢業自格拉斯哥大學醫學院，為同班同學中以「推薦」的優秀成績畢業。他自小的成長環境乃是尊奉上帝的旨意及教導的教會生活，基督教文化與思想及為人奉獻的情懷很深。
當他醫學院快畢業時（1888年的上半年），適逢馬雅各醫生和巴克禮牧師回到英國，兩人到英格蘭、蘇格蘭各地的教會演講，為台灣的教會籌募奉獻款，宣傳台灣中部需要設醫院的重要性，徵求年青人到台灣擔任宣教師，或擔任醫療傳教醫生。盧加閔受他們感動，醫學院畢業後就申請成為醫療宣教醫生，動身出發來台灣。
1888年12月22日（清光緒拾肆年）抵台，先在台南學習語言與在醫院學習跟診。盧加閔來台，開啟台灣中部基督教醫療貢獻的源頭，他到台灣時才剛滿22歲。